Protein–RNA interactions for Protein: A6NJY4

Putative transmembrane protein LOC100289255, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJY4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NJY4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NJY4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NJY4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NJY4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NJY4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NJY4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NJY4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NJY4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NJY4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
A6NJY4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
A6NJY4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NJY4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NJY4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NJY4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NJY4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NJY4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NJY4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NJY4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NJY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NJY4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NJY4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NJY4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NJY4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NJY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NJY4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NJY4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NJY4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NJY4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NJY4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NJY4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NJY4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NJY4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NJY4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NJY4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NJY4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NJY4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NJY4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NJY4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NJY4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NJY4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NJY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A6NJY4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A6NJY4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A6NJY4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A6NJY4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A6NJY4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A6NJY4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A6NJY4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A6NJY4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A6NJY4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A6NJY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A6NJY4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A6NJY4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A6NJY4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms