Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC10BA6NIK2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC10BA6NIK2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms