Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XIRP2A4UGR9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
XIRP2A4UGR9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XIRP2A4UGR9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms