Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2E0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2E0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J2E0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J2E0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J2E0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J2E0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J2E0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J2E0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J2E0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms