Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB23Q9ULC3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms