Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms