Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms