Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBQLN4Q9NRR5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBQLN4Q9NRR5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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