Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms