Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms