Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CTF1Q16619 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms