Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMD6Q15008 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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