Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCLAFQ15004 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms