Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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