Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
EBI3Q14213 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms