Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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