Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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