Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms