Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX2P28328 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms