Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRCP23327 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HRCP23327 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRCP23327 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HRCP23327 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms