Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRHP20396 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRHP20396 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRHP20396 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRHP20396 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRHP20396 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRHP20396 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRHP20396 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRHP20396 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRHP20396 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms