Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIG1P18858 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LIG1P18858 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LIG1P18858 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIG1P18858 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms