Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF2P04141 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms