Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAPBO95292 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAPBO95292 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAPBO95292 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms