Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEBLO76041 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEBLO76041 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEBLO76041 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEBLO76041 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEBLO76041 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEBLO76041 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEBLO76041 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEBLO76041 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEBLO76041 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms