Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms