Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIMKLBQ9ULI2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMKLBQ9ULI2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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