Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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