Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP2Q9P2J9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms