Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf109Q9NX04 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms