Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GOPCQ9HD26 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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