Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms