Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FNDC11Q9BVV2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms