Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms