Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms