Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms