Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms