Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms