Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms