Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms