Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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