Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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