Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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