Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
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