Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms