Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms