Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms