Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNPDA1P46926 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms