Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLD1P28340 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLD1P28340 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLD1P28340 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms