Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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